Die Anwendungsmodule der Serie Tektronix MDO3000 sind eigenständige Produkte, die beim Kauf des MDO3000-Oszilloskops oder zu einem späteren Zeitpunkt erworben werden können. Das Modul MDO3COMP für die serielle Ansteuerung und Analyse für Computer ermöglicht die Ansteuerung mit Informationen auf Paketebene auf Bussen gemäß RS-232/422/485/UART sowie die Nutzung von Analysewerkzeugen wie digitalen Ansichten des Signals, Busansichten, Paketdecodierung, Suchwerkzeuge und Paketdecodierungstabellen mit Zeitstempelinformationen.
Die Anwendungsmodule der Serie MDO3000 verfügen über Lizenzen, die zwischen einem Anwendungsmodul und einem Oszilloskop übertragen werden können. Die Lizenz kann im Modul gespeichert werden, sodass es von einem Messgerät zum nächsten übertragen werden kann. Oder die Lizenz kann im Oszilloskop gespeichert werden, womit das Modul entfernt und sicher aufbewahrt werden kann. Die Lizenz kann zurück auf das Modul übertragen werden, falls ein anderes MDO3000-Oszilloskop verwendet werden soll. Die Übertragung der Lizenz auf ein Oszilloskop und das Entfernen des Moduls ermöglicht die Verwendung von mehr als zwei Anwendungen gleichzeitig.